Otizm, kızlarda ve erkeklerde farklı şekillerde ortaya çıkabilir .
Erkek çocuklarda otizm genellikle daha belirgin ve dışa dönüktür . Bu çocuklarda sosyal iletişim sorunları, tekrarlayıcı davranışlar ve davranışsal problemler daha sık görülür .
Kız çocuklarda otizm ise daha ince ve içe dönük olabilir . Sosyal etkileşimdeki zorluklar daha az belirgin olabilir ve kız çocuklar sosyal maskelenme eğilimindedirler . Bu nedenle, kız çocuklarda otizmin tanısı genellikle daha geç konulabilir .
Her iki cinsiyette de ortak olan otizm belirtileri arasında ise sosyal ipuçlarını anlamada zorluk, duyusal hassasiyetler ve belirli rutinlere bağlılık yer alır .