Mustafa Kemal Paşa, Havza'da bulunduğu dönemde (25 Mayıs - 12 Haziran 1919) çeşitli önemli çalışmalar yürütmüştür: 1. Mitingler ve Gösteriler: İzmir'in işgalini protesto etmek amacıyla mitingler düzenlenmesini istemiş ve bu gösterilerde gayrimüslim halka kötü davranılmaması gerektiğini vurgulamıştır. 2. Milli Teşkilatların Kurulması: Milli derneklerin yaygınlaşmasını sağlamış ve milis kuvvetlerin kurulmasını teşvik etmiştir. 3. Askeri Birliklerin Durumu: Ordunun terhisini önlemek ve askeri birlikleri kendi emrine almak için çalışmıştır. 4. İstanbul Hükümeti ile İlişkiler: İstanbul Hükümeti'ne ve İtilaf Devletleri'ne telgraflar çekerek işgallere karşı tepki göstermiştir. 5. Strateji Belirleme: Milli Mücadele hareketinin stratejisini belirlemiş ve Amasya Genelgesi'nin hazırlıklarına başlamıştır.