Merkez Efendi Külliyesi'nde yatan bazı önemli kişiler şunlardır: Merkez Efendi (Musa Muslihiddîn): Külliyenin kurucusu, Halvetiyye'nin Sünbüliyye koluna mensup mutasavvıf ve hekim, 1552 yılında vefat etmiş ve külliyenin yanına defnedilmiştir. Tanburî Cemil Bey: 1900'lerin başında yaşamış ünlü müzisyen, Merkez Efendi Kabristanı'nda yatmaktadır. Kenan Rifai Büyükaksoy: Tasavvuf büyüğü, külliyenin kabristanında yer almaktadır. Sadettin Kaynak: Besteci ve müzisyen, Merkez Efendi Tekkesi'ne komşudur. Ayrıca, külliyenin haziresinde Osmanlı ve Cumhuriyet döneminden birçok mutasavvıf, müzisyen, mimar ve edebiyatçının mezarları da bulunmaktadır.