Karaçay-Malkar Türkleri, Kıpçak Türkleri ve Bulgar Türkleri başta olmak üzere, tarih boyunca Kafkasya'da hâkimiyet kuran Kimmer, İskit, Hun, Alan, Hazar gibi çeşitli Türk boylarının etnik ve sosyokültürel bütünleşmesinden ortaya çıkmıştır. Ayrıca, Karaçay-Malkar halkının oluşumunda Sabir Hunlarının da etkisi olduğu düşünülmektedir.