Amasya'da kongre, Kurtuluş Savaşı döneminde milli mücadelenin örgütlenmesi ve ulusal iradenin belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Bu kongrenin düzenlenmesinin başlıca nedenleri şunlardır: - İstanbul Hükümeti'nin yetersizliğinin vurgulanması: Amasya Genelgesi ile İstanbul Hükümeti'nin görevlerini yerine getirmediği belirtilmiş ve bu durum millete duyurulmuştur. - Milli egemenlikten bahsedilmesi: İlk kez ulusal egemenliğe dayanan bir yönetimden bahsedilmiş ve milletin bağımsızlığını kendi azmi ve kararıyla kurtarabileceği ifade edilmiştir. - Sivas'ta bir kongre toplanması: Amasya Genelgesi ile Sivas'ta gizli bir kongre düzenlenmesi gerektiği kararlaştırılmıştır.