Kamu kurumlarında muhasebe sistemi şu şekilde olmalıdır: 1. Çift Taraflı Kayıt Sistemi: Her türlü muhasebe işlemi çift taraflı kayıt sistemine göre kaydedilmelidir. 2. Standart ve Genel Kabul Görmüş İlkeler: Muhasebe uygulamaları, uluslararası standartlara uygun olarak belirlenmeli ve uygulanmalıdır. 3. Tahakkuk Esası: Mali işlemler tahakkuk esasına göre kaydedilmeli, gelirler tahsil edildiği, giderler ise ödendiği yılda muhasebeleştirilmelidir. 4. Belgeye Dayanma Zorunluluğu: Tüm muhasebeleştirme işlemleri kanıtlayıcı belgelere dayandırılmalıdır. 5. Hesap Planının Detayı: Yöneticilerin yönetim ihtiyaçlarına uygun detayda bir hesap planı kullanılmalıdır. 6. Mali Tabloların Tamlığı: Mali tablolar, doğru ve anlaşılır şekilde düzenlenmeli, tam ve zamanında iç ve dış kullanıcılara sunulmalıdır. Ayrıca, Bütünleşik Kamu Mali Yönetim Bilişim Sistemi (BKMYBS) kullanılarak muhasebe süreçlerinin entegrasyonu ve otomasyonu sağlanmalıdır.