KDV istisnası ile alınan malların muhasebeleştirilmesi, işletmenin KDV mükellefiyeti durumuna göre değişiklik gösterir: KDV mükellefiyeti olmayan işletmeler: Bu işletmeler, KDV istisnası kapsamında aldıkları malları iade ettiklerinde, iade faturasında KDV göstermezler; fatura KDV dahil olarak düzenlenir. KDV mükellefiyeti olan işletmeler: KDV mükellefleri, istisna kapsamında aldıkları malların bedelindeki KDV'yi iç yüzde yoluyla hesaplar ve "indirilecek KDV" olarak dikkate alır. KDV istisnası kapsamında alınan malların muhasebe kayıtlarına örnek: A.Ş.'nin 10.000 TL + 2.000 TL KDV ile aldığı bir malzemeyi iade etmesi: A.Ş.'nin kayıtları: 770 GENEL YÖNETİM GİDERLERİ 12.000, 320 SATICILAR 12.000. Satıcının kayıtları: 120 ALICILAR 12.000, 600 YURTİÇİ SATIŞLAR 10.000, 391 HESAPLANAN KDV 2.000, 610 SATIŞTAN İADELER 10.000, 191 İNDİRİLECEK KDV 2.000. KDV istisnası kapsamındaki işlemler ve muhasebe kayıtları, işletmenin faaliyet gösterdiği sektöre ve istisna türüne göre değişiklik gösterebilir. Detaylı bilgi için bir muhasebe uzmanına danışılması önerilir.