İstanbul Sabiha Gökçen Havalimanı'nda meydana gelen Pegasus kazasının nedeni olarak birkaç faktör belirlenmiştir: 1. Pistin Temizlenmemesi: Kazaya yol açan faktörlerden biri, pistin gerektiği gibi temizlenmemesi ve kaygan zemin oluşmasıdır. 2. Yıldırım Çarpması: İniş sırasında uçağa yıldırım çarpması, pilotlarda stres yaratmış ve uçağın sisteminin bozulmasına sebep olmuştur. 3. Hava Muhalefeti: Hava muhalefeti nedeniyle iniş sırasında hızın gerçekte 84 knot olması ve zamanında frenleme yapılamaması da kazanın nedenleri arasında yer almaktadır. 4. Pist Hatası: Pistin sonunda stopway (durma bölgesi) alanının bulunmaması ve devamında uçurumun olması, uçağın kontrolünü kaybetmesinde etkili olmuştur.