Hidrojen bağı, hidrojenin oksijen, azot, flor gibi elektronegatifliği yüksek elementlerle oluşturduğu moleküller arasında ortaya çıkan zayıf bir etkileşim türüdür. Bu bağda, hidrojene kovalent olarak bağlanmayan elektronegatif atom proton alıcısı, hidrojene kovalent olarak bağlanan atom ise proton vericisi olarak adlandırılır. Hidrojen bağının bazı özellikleri: Molekül içi ve moleküller arası olabilir. Enerjisi 1 ila 40 kcal/mol arasında değişir. Maddelerin kaynama noktalarını yükseltir. Proteinlerin ve nükleik asitlerin ikincil ve üçüncül yapılarını etkiler. Su gibi maddelerin sıra dışı fiziksel özelliklerinden sorumludur.