Van der Waals kuvvetleri ve hidrojen bağı arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Kuvvet Türü: Van der Waals kuvvetleri, kovalent olmayan zayıf etkileşimlerdir. 2. Oluşum Şekli: Van der Waals kuvvetleri, iki kalıcı dipol, dipol-indüklenmiş dipol veya iki indüklenmiş dipol arasında oluşabilir. 3. Yönelim: Van der Waals kuvvetleri yönsüzdür, yani herhangi iki molekül arasında oluşabilir. 4. Enerji: Hidrojen bağları, Van der Waals kuvvetlerinden daha yüksek enerjiye sahiptir.