• Buradasın

    Real time PCR stripleri ve plakaları nelerdir?

    Yazeka

    Arama sonuçlarına göre oluşturuldu

    Real-time PCR stripleri ve plakaları, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) sırasında DNA amplifikasyonunu gerçek zamanlı olarak izleyen moleküler biyoloji laboratuvar tekniklerinde kullanılır 24.
    Real-time PCR plakaları arasında Eppendorf'un Twin.tec® Real-Time PCR plakaları bulunur 13. Bu plakaların özellikleri:
    • Beyaz kuyular: Flüoresan ışığını daha iyi yansıtır, bu da testlerin hassasiyetini artırır 3.
    • Polipropilen kuyucuklar: Numuneye optimum ısı transferi sağlar 5.
    • Polikarbonat çerçeve: Dayanıklılık sunar ve iş akışını düzenlemeye yardımcı renk alternatifleri içerir 5.
    • Yükseltilmiş kuyucuk kenarları: Sızıntıyı önleyerek çapraz kontaminasyonu minimize eder 5.
    Real-time PCR stripleri ise Eppendorf'un Real-time PCR stripleridir 5. Bu striplerin özellikleri:
    • İnce duvarlı polipropilen malzeme: Numuneler için etkili ve homojen ısı transferi sağlar 5.
    • 0,1 ml hacim: Küçük örnek hacimleri için güvenli çalışma sunar 5.

    Konuyla ilgili materyaller

    PCR yöntemi nasıl çalışır?

    PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) yöntemi, DNA'nın laboratuvar ortamında enzimler aracılığıyla kendi kopyasını oluşturduğu bir süreçtir: 1. Denatürasyon: Sıcaklık 90°C üzerine çıkarılarak DNA'nın ikili zinciri kopar ve iki ayrı zincir elde edilir. 2. Bağlanma (Annealing): Sıcaklık düşürülerek, kısa nükleotid dizileri (primerler) kalıp DNA'ya bağlanır. 3. Uzama: Sıcaklık 72°C'ye çıkarılarak Taq polimeraz enzimi, primerlere yeni nükleotidler ekler ve DNA zinciri uzar. Genellikle 25-35 kez tekrarlanan bu döngüler sonucunda, ilgili DNA bölgesinden milyonlarca kopya üretilir. PCR yöntemi, hastalıkların teşhisinde, DNA haritalama ve dizi analizinde, tarımda tohum saflığının belirlenmesinde ve adli tıpta suçlu profillerinin çıkarılmasında kullanılır.

    PCR ve moleküler test aynı mı?

    PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) ve moleküler test aynı kavramı ifade eder. Moleküler test, biyolojik materyallerden (DNA, RNA, proteinler veya yağlar) örnekler alınarak, bu materyallerin yapısını ve özelliklerini inceleyen testleri kapsar.

    PCR çeşitleri nelerdir?

    PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) çeşitleri şunlardır: 1. Yuvalanmış (Nested) PCR: İlk PCR'dan elde edilen ürünün ikinci bir amplifikasyon için kalıp olarak kullanılması. 2. Demirlenmiş (Anchored) PCR: Çoğaltılacak DNA'nın sadece bir bölgesinin bilindiği durumda uygulanır. 3. Geri (Revers) Transkripsiyon PCR (RT-PCR): RNA'dan tamamlayıcı DNA sentezi ve bu DNA'nın standart PCR ile çoğaltılması. 4. Asimetrik PCR: Fazla miktarda çoğaltılan tek iplikli ürünün dizilenmesi için kullanılır. 5. Çoklu (Multipleks) PCR: Bir PCR ile birden fazla hedef dizinin birlikte çoğaltılması. 6. Real Time PCR: Ürünlerin analizi reaksiyon sırasında yapılır, floresan boyalar veya problar kullanılır. 7. Hot Start PCR: DNA polimerazın düşük sıcaklıklarda aktif olmasını önleyerek özgül olmayan amplifikasyonları azaltır.

    RT-PCR ve qPCR farkı nedir?

    RT-PCR (Reverse Transcription PCR) ve qPCR (Kantitatif PCR) arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Başlangıç Materyali: RT-PCR, RNA ile çalışırken, qPCR hem DNA hem de RNA ile çalışabilir. 2. Enzimler: RT-PCR, ters transkriptaz ve DNA polimeraz enzimlerini kullanırken, qPCR sadece DNA polimeraz enzimini kullanır. 3. Amplifikasyon: RT-PCR, RNA'nın cDNA'ya dönüştürülmesinden sonra amplifikasyon yaparken, qPCR doğrudan DNA veya cDNA'nın amplifikasyonunu izler. 4. Gerçek Zamanlı İzleme: qPCR, amplifikasyon sürecini gerçek zamanlı olarak izler ve floresan problar veya boyalar kullanarak miktarı ölçer, RT-PCR ise sadece amplifikasyonun sonunda sonuç verir. 5. Duyarlılık: qPCR, daha hassas olup düşük seviyelerde DNA veya RNA moleküllerini tespit edebilirken, RT-PCR sadece dönüştürülmüş cDNA moleküllerini tespit edebilir.

    RT-qPCR ne için kullanılır?

    RT-qPCR (ters transkripsiyon-kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu), çeşitli amaçlarla kullanılan bir moleküler biyoloji tekniğidir: Teşhis: Bulaşıcı hastalıklar, kanser ve genetik anormalliklerin teşhisi için ilgili nükleik asitleri hızlı bir şekilde tespit eder. Gen ifadesi miktar tayini: RNA miktar tayini durumunda, şablon ribonükleik asidin (RNA) ters transkripsiyonuyla elde edilen tamamlayıcı DNA'nın (cDNA) oluşturulması gerekir. Araştırma: Gıdalardaki veya bitkisel maddelerdeki mikrobiyal yükün ölçülmesi, genetiği değiştirilmiş organizmaların (GDO) saptanması ve insan viral patojenlerinin miktarının belirlenmesi ve genotiplenmesi gibi araştırmalarda kullanılır.

    RT PCR ile mRNA ölçümü nasıl yapılır?

    RT-PCR ile mRNA ölçümü şu şekilde yapılır: 1. Ters Transkripsiyon (RT). 2. PCR Amplifikasyonu. 3. Floresans Ölçümü. 4. Normalizasyon. RT-PCR, mRNA miktarını belirlemenin yanı sıra, genlerin hücredeki ekspresyon seviyesini de tespit etmeye olanak tanır.

    PCR ve Real Time PCR farkı nedir?

    PCR (Polymerase Chain Reaction) ve Real Time PCR (Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu) arasındaki temel farklar şunlardır: Algılama Yöntemi: PCR'da amplifiye DNA'nın tespiti, süreç tamamlandıktan sonra yapılır ve genellikle jel elektroforezi kullanılır. Real Time PCR'da ise floresan boyalar veya problar sayesinde her döngüde sinyal üretilir ve amplifikasyon süreci gerçek zamanlı olarak izlenebilir. Kantitasyon: PCR, hedef DNA'nın varlığını veya yokluğunu belirler, ancak kesin miktar ölçümü yapmaz. Real Time PCR, amplifikasyon sırasında DNA miktarını kesin olarak ölçer; bu, özellikle viral yüklerin nicelleştirilmesi ve gen ekspresyon seviyelerinin analizi gibi durumlarda avantaj sağlar. Zaman Verimliliği: PCR'da sonuçları analiz etmek için jel elektroforezi gibi ek adımlar gereklidir, bu da süreci yavaşlatır. Real Time PCR, tespit işlemini amplifikasyon sürecine entegre eder ve daha hızlı sonuç verir. Hassasiyet ve Doğruluk: PCR, düşük DNA konsantrasyonlarını güvenilir bir şekilde tespit etmekte zorlanabilir. Real Time PCR, floresan problar sayesinde daha yüksek hassasiyet ve doğruluk sunar. Kullanım Alanları: PCR, genellikle klonlama, dizileme, mutajenez çalışmaları ve patojen tespiti gibi durumlarda kullanılır. Real Time PCR ise gen ekspresyon analizi, tanı testleri, genetik araştırmalar ve gıda güvenliğinde kalite kontrolü gibi hassas ölçüm gerektiren uygulamalarda tercih edilir.