Molekül, birbirine bağlı gruplar halindeki atomların oluşturduğu kimyasal bileşiklerin en küçük temel yapısına verilen addır. Diğer bir ifadeyle bir molekül, bir bileşiği oluşturan atomların eşit oranlarda bulunduğu en küçük birimdir. Bir molekül, aynı iki atomun bağlanması sonucu ya da farklı sayılarda farklı atomların bağlanması sonucunda oluşabilir. Molekülleri oluşturan kimyasal bağlara moleküler bağlar denir.