Kofül ve lizozomun görevleri farklıdır. Lizozomun görevleri: Hücre içi sindirim ve savunma organelidir. Hücrenin endositoz ile aldığı büyük moleküllü maddelerin sindiriminde görev alır. İçindeki enzimlerinin serbest kalmasıyla hücrenin parçalanmasına neden olur; bu olaya otoliz denir. Kofülün görevleri: Hücre içinde oluşan artıkların, besinlerin ve fazla sıvıların depolandığı yapılardır. Hücre içi osmatik basınç ve pH’ı ayarlar. Metabolizmanın aktiflik derecesini belirler. Dolayısıyla, lizozom hücre içi sindirimi sağlarken, kofül depolama ve osmatik basınç düzenleme gibi işlevlere sahiptir.