Klorofil ve kloroplast arasındaki temel farklar şunlardır: Klorofil, pigment; kloroplast ise organeldir. Klorofil, fotosentez sürecinde bitkinin besin üretimini sağlarken, kloroplast fotosentezin gerçekleştiği organeldir. Klorofil, bitkilerin yeşil rengini verirken, kloroplast yeşil olmasının yanı sıra karotenoidler nedeniyle kırmızı ve sarı tonlarda da olabilir. Klorofil, kloroplastın içinde bulunur. Kloroplast, bitki hücresinin bir parçasıyken, klorofil bir bitki hücresinin parçası değildir. Kloroplast, bitki yapraklarında büyük konsantrasyonlarda bulunurken, klorofil tüm yeşil bitkilerde ve fotosentetik canlılarda bulunur. Ayrıca, prokaryot hücrelerde klorofil pigmenti hücre zarına bağlı olacak şekilde sitoplazmada bulunur.