Herakleitos'a "karanlık filozof" denmesinin sebebi, felsefesini kapalı bir anlatımla ve herkesin anlayamayacağı şekilde, şiir-düz yazı arası bir üslupla yazmış olmasıdır. Ayrıca, Aristokrat bir aileden geldiği için, üst kesime hitap etme çabası içinde olması da bu lakabı pekiştirmiştir. Herakleitos'un kullandığı dil, aynı zamanda imgelerle dolu olduğu için de bu lakap uygun görülmüştür. Tüm bu nedenlerden dolayı, Antik Yunan'da ondan "karanlık Herakleitos" diye bahsedilmiştir.