Herakleitos'a "karanlık filozof" denmesinin birkaç nedeni vardır: 1. Anlaşılmaz Üslup: Herakleitos, yazılarını ve konuşmalarını çok güç anlaşılır, karanlık bir üslup ile, özdeyişler biçiminde ortaya koymuştur. 2. Aktif Katılım Beklemesi: Okuyucularından aktif bir felsefi katılım ve çaba beklediği için okuyucusunu zorlayan bir filozof olarak görülmüştür. 3. Kapalı ve Gizemli İfadeler: Herakleitos'un kapalı ve gizemli ifadeleri, onun peygamber olarak bile anılmasına yol açmıştır.