Mutasyonlar, kendi başlarına iyi veya kötü değildir. Zararsız (nötr) mutasyonlar, meydana geldikleri anda canlıya pek bir etki yaratmazlar. Yararlı mutasyonlar, organizmanın hayatta kalmasına ve üremesine katkı sağlar. Zararlı mutasyonlar, spesifik genlerin işlevini bozarak hastalıklara yol açar. Belli şartlar altında dezavantajlı etkilere sahip bir mutasyon, çevrenin değişmesiyle avantajlı hale gelebilir.