Fen Bilimleri Öğretim Programı'nın temel ilkeleri şunlardır: Öğrenciyi merkeze alan bütüncül eğitim yaklaşımı: Eğitsel süreçleri genişletir ve derinleştirir, bireysel sorumluluğu destekler, sosyal-duygusal becerileri geliştirir. Disiplinler arası ve disiplinler üstü fen öğretimi: Öğrencilerin farklı disiplinlerde sahip oldukları bilgi ve becerileri kullanmalarını sağlar. Sürdürülebilirliği temel alan fen öğretimi: Kaynakları verimli kullanan, doğaya duyarlı bireyler yetiştirmeyi hedefler. Bilimsel sorgulama ve mühendislik tasarım temelli öğrenme: Probleme dayalı, proje tabanlı, buluş yoluyla ve araştırma-incelemeye dayalı öğretim stratejileri kullanılır. Üst düzey düşünme becerilerinin geliştirilmesi: Akıl yürütme, analiz etme, eleştirel düşünme, yorumlama ve tahmin etme gibi beceriler geliştirilir. Ölçme ve değerlendirme yaklaşımı: Bilimsel okuryazarlık becerilerinin geliştirilmesini hedefler. Önceki öğrenmelerin dikkate alınması: Öğrencilerin önceki bilgileri hatırlanır ve öğrenme-öğretme uygulamaları buna göre düzenlenir. Öğrenme-öğretme sürecinin başında ön değerlendirme yapılması: Öğrencilerin ön bilgileriyle yeni öğrenmeleri arasında bağlantı kurulur.