Farmakoloji ve farmakognozi arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Farmakoloji: İlaçların kaynaklarını, kimyasal ve fiziksel özelliklerini, vücuda alınışlarını, etkilerini, etki şekillerini ve hastaya verilecek hale getirilme yöntemlerini inceleyen bilim dalıdır. 2. Farmakognozi: Biyolojik kaynaklı (bitkiler, hayvanlar, mikroorganizmalar ve deniz canlıları) drogların biyolojik etkilerini inceleyen ve analiz eden bilim dalıdır.