Farmakoloji ve farmasötik kimya farklı bilim dallarıdır, ancak birbirleriyle ilişkilidirler. Farmakoloji, ilaçların kaynaklarını, kimyasal ve fiziksel özelliklerini, vücuda alınışlarını, etkilerini ve etki şekillerini inceleyen bilim dalıdır. Farmasötik kimya ise ilaçların kimyasal yapısını ve özel şekillerde hazırlanmasını (tablet, merhem, ampul, kapsül vb.) inceleyen bir bilim dalıdır. Bu nedenle, farmasötik kimya, farmakolojinin bir alt dalı olarak kabul edilebilir.