Doku mühendisliğinde çeşitli hücreler kullanılır, bunlar arasında: 1. Kök hücreler: Embriyonik kök hücreler, uyarılmış pluripotent kök hücreler ve yetişkin multipotent kök hücreler yaygın olarak kullanılır. 2. Mezenkimal kök hücreler: Kemik iliği kökenli ve adipoz doku kökenli mezenkimal kök hücreler, hedef doku ve organ yapısına farklılaşma yetenekleri nedeniyle tercih edilir. 3. Keratinositler ve fibroblastlar: Özellikle deri doku mühendisliğinde kullanılır. 4. Hepatositler: Karaciğer doku mühendisliğinde kullanılır. 5. İnsan umbilikal kord ven hücreleri ve fibroblastlar: Damar doku mühendisliğinde çalışılır. Bu hücreler, doku iskeleleri üzerine yerleştirilerek, biyokimyasal ve fizikokimyasal faktörlerle birlikte kullanılarak dokuların onarımı, sürdürülmesi, iyileştirilmesi veya değiştirilmesi sağlanır.