Gıdalarda yaygın olarak kullanılan bazı enzimler şunlardır: Amilaz: Nişastayı şekerlere dönüştürür, ekmek ve diğer unlu mamullerin üretiminde kullanılır. Proteaz: Proteinleri amino asitlere parçalar, et ve süt ürünlerinin dokusunu yumuşatır. Lipaz: Yağları yağ asitleri ve gliserole dönüştürür, özellikle peynir ve tereyağı gibi yağlı gıdaların aroma ve tadını geliştirir. Selülaz: Bitkisel hücre duvarlarını parçalar, sebze ve meyve işleme süreçlerinde kullanılır. Pektinaz: Pektin maddesini parçalayarak ürünlerin dokusunu yumuşatır, reçel ve jöle üretiminde kullanılır. Ayrıca, invertaz, laktaz, renin gibi enzimler de gıda endüstrisinde çeşitli amaçlarla kullanılmaktadır.