Fiziksel sindirim, diğer bir adıyla mekanik sindirim, ağızda başlar ve ince bağırsakta biter. Ağızda, besinlerin çiğneme ve tükürükteki enzimler yardımıyla küçük parçalara ayrılmasıyla mekanik sindirim başlar. Midede, besinlerin mide asitleri ile iyice öğütülmesiyle fiziksel sindirimin büyük bir kısmı tamamlanır. İnce bağırsakta, safra salgısı ile besinlerin en küçük hale getirilmesiyle fiziksel sindirim sona erer.