Alsancak Garı, farklı nedenlerle geçici veya kalıcı olarak kapatılmıştır: İZBAN çalışmaları: 2012 yılında, Hilal Aktarma İstasyonu ve Kahramanlar-Akıncılar karayolu altgeçidi inşaat çalışmaları nedeniyle Alsancak Garı yönündeki aktarma seferleri geçici olarak durdurulmuş, gar devre dışı bırakılmıştır. Tramvay hattı projesi: 2017 yılında, İzmir Büyükşehir Belediyesi'nin tramvay hattı projesi nedeniyle Alsancak Garı önünde trafik düzeninde zorunlu değişikliklere gidilmiş, gar önü kısmen trafiğe kapatılmıştır. Atatürk Vagonu: 2020 yılında, "hava koşullarından olumsuz etkileneceği" gerekçesiyle Atatürk Vagonu, Alsancak Garı'ndan kaldırılarak kapalı bir alana taşınmış ve ziyarete kapatılmıştır.