Peugeot 106 GTI'ın tutulmama sebepleri arasında şunlar sayılabilir: Yol tutuşu: 106 GTI, yol tutuşu açısından diğer Peugeot modellerine göre daha iyi olsa da, bazı kullanıcılar tarafından olduğundan daha iyi yol tutuşluymuş gibi kullanıldığı için kazalar meydana gelmiştir. Kronik sorunlar: Oksijen sensörü, motor kulakçıkları, üst kapak contası gibi parçalarda sık sık arızalar yaşanabilir. Sigorta maliyetleri: Avrupa'da sigorta primlerini düşük tutmak amacıyla, 106 GTI'ın bazı özellikleri katalogda düşük gösterilmiştir. Modifiye: 106 GTI, apaçi olarak bilinen modifiyeciler tarafından tercih edildiği için olumsuz bir imaj kazanmıştır. Ayrıca, 2003 yılından sonra 206 GTI'ın piyasaya sürülmesi, 106 GTI'ın satışlarının düşmesine neden olmuştur.