Seferihisar'da çeşitli ağaç türleri bulunmaktadır, bunlar arasında: Fıstık çamı, kara servi, mavi servi; Mantar meşesi ve palamut meşesi; Sakız ağacı; Zeytin ve narenciye ağaçları. Ayrıca, ilçenin doğal bitki örtüsü arasında delice, menengiç, zakkum, katırtırnağı ve fundalar da yer almaktadır.