Rektal muayene, çeşitli sağlık sorunlarının teşhis edilmesi ve tedavi sürecinin planlanması için yapılır. Bu muayene ile aşağıdaki durumlar değerlendirilebilir: Prostat sağlığı: Erkeklerde prostat bezinin boyutu, şekli ve dokusunun kontrolü. Bağırsak problemleri: Kabızlık, ishal, dışkı ve idrar kaçırma gibi şikayetlerin nedeni. Rektum ve anal bölge: Hemoroid, anal fissürler, rektal tümörler ve diğer rektum hastalıklarının teşhisi. Pelvik organlar: Kadınlarda uterus ve yumurtalıklar gibi üreme organlarındaki problemlerin kontrolü. Rektal muayene ayrıca, rutin tıbbi muayenelerin bir parçası olarak da uygulanabilir.