Selçuklu bayrağı üzerindeki çift başlı kartal, farklı anlamlar taşımaktadır: İktidar ve güç sembolü: Çift başlı kartal, hem İslam öncesinde Şamanizmde güçlü bir sembol olarak yer almış, hem de İslam sonrasında kudret ve gücü ifade etmiştir. Kraliyet nişanesi: Hititlerde çift başlı kartal, kraliyet amblemi ve hükümdarın simgesi olarak kullanılmıştır. Zıtlıkların dengesi: Türk kültüründe çift başlı kartal, gece ve gündüz, yer ve gök gibi zıtlıkları temsil eder. Koruyucu sembol: Kalelerde şehrin koruyucusu, sarayda ise asaletin sembolü olarak kullanılmıştır. Çift başlı kartalın Selçuklu bayrağı üzerindeki kullanımı, bazı tarihçilere göre Bizans'tan alınmış bir sembol iken, diğer tarihçiler Selçukluların bu sembolü Gaznelilerden aldığını savunmaktadır.