Papirüs kağıdının yok olmasının birkaç nedeni vardır: 1. İklim Değişiklikleri: Nil Nehri'nin suyunun dönemsel yükselişi ve alüvyon birikimi, papirüs bitkisinin yetiştiği tatlı su bataklıklarının tuzlu bir bataklığa dönüşmesine yol açtı. 2. Yeni Yazı Malzemeleri: MS 2. yüzyılda parşömenin, 8. ve 9. yüzyıllarda ise diğer bitki liflerinden yapılan kağıdın ortaya çıkması, papirüs kağıdına olan talebi azalttı. 3. Üretim Tekniğinin Gizliliği: Eski Mısırlılar, papirüs kağıdının üretim yöntemini gizli tutmuşlardı ve bu teknik unutulunca papirüs yetiştiriciliği de sona erdi.