Gastroenterolojik cerrahi, sindirim sistemi hastalıklarının cerrahi tedavisini gerçekleştirir ve aşağıdaki ameliyatları yapar: Yemek borusu ameliyatları: Reflü, hiatal herni (mide fıtığı), akalazya gibi hastalıkların cerrahi tedavisi. Mide ve duodenum ameliyatları: Mide kanseri, morbid obezite, metabolik cerrahi ve tümörler. İnce ve kalın bağırsak ameliyatları: Ülseratif kolit, Crohn hastalığı ve bağırsak kanserleri. Anüs ve anal kanal ameliyatları: Fissür, fistül, hemoroid ve inkontinans gibi hastalıkların tedavisi. Karaciğer, pankreas, safra kesesi ve safra yolları ameliyatları: Karaciğer kanseri, kist hidatik, safra kesesi taşı ve polipleri, pankreas kanseri ve kistleri. Diğer ameliyatlar: Apendektomi, kolesistektomi, Whipple prosedürü ve karın duvarı fıtıkları. Gastroenterolojik cerrahi, laparoskopik, robotik veya açık yöntemlerle müdahaleler gerçekleştirir.