Kefir, çeşitli şekillerde tüketilebilir: Sade tüketim: Kefir, aç veya tok karnına, yemeklerden önce, sonra veya yatmadan önce içilebilir. Meyveli tüketim: Kefir, içine meyve püresi eklenerek veya meyve ile birlikte blenderdan geçirilerek tüketilebilir. Yemeklere ekleme: Çorba gibi yemek çeşitlerine eklenebilir. Alternatif kullanım: Krema ve diğer süt ürünlerinin kullanıldığı tüm tariflerde kefir alternatif olarak tercih edilebilir. Günlük tüketim miktarı, yetişkinler için bir su bardağı (250 ml) olarak ayarlanmalıdır. Laktoz hassasiyeti olan bireylerin dikkatli olması gerekir; kefir, en az laktoz içeren süt ürünlerinden biri olsa da laktoz hassasiyeti olan kişilerde gaz problemi yaratabilir. Özel beslenme programı bulunan bireylerin, örneğin diyabet hastalarının, öğünlerine uygun şekilde kefir tüketmeleri gerekebilir. Kefir tüketmeden önce, özellikle bağışıklık sistemini zayıflatan bir hastalık veya yakın zamanda cerrahi bir işlem geçirildiyse, uzman tavsiyesi alınması önerilir.