Gemilerde atık su, gelişmiş sistemler kullanılarak boşaltılır. Bu süreç şu adımları içerir: 1. Toplama: Gemideki tüm tuvaletler ve lavabolar, merkezi bir atık su toplama sistemine bağlıdır ve atıklar büyük tanklarda toplanır. 2. İşleme: Toplanan atık su, gemi içerisindeki bir atık su arıtma tesisinde işlenir. Bu tesiste: - Mekanik filtrasyon ile büyük katı parçacıklar ayrılır. - Biyolojik arıtma ile organik maddeler mikroorganizmalar kullanılarak parçalanır. - Kimyasal arıtma ile dezenfektanlar kullanılarak zararlı mikroorganizmalar öldürülür. 3. Bertaraf: İşlenmiş atık su, uluslararası denizcilik kurallarına uygun şekilde denize boşaltılır. 4. Katı atık yönetimi: Mekanik filtrasyon sırasında ayrılan katı atıklar ve işleme sonucu oluşan çamur, gemide depolanır ve limana ulaşıldığında uygun şekilde bertaraf edilir.