Ağızda en çok bulunan bakteriler şunlardır: 1. Streptococcus mutans: Diş plağı oluşumunda ve diş çürümesinde rol oynar. 2. Porphyromonas gingivalis: Periodontal hastalıklarla ilişkilidir ve diş eti iltihabına neden olabilir. 3. Prevotella intermedia: Periodontal hastalıklarla bağlantılı bir diğer bakteridir. 4. Tannerella forsythia: Diş eti iltihabı ve periodontit ile ilişkilendirilir. 5. Fusobacterium nucleatum: Yaygın olarak diş plağında bulunur ve çeşitli ağız hastalıklarıyla ilişkilidir. Ayrıca, ağızda Lactobacillus ve Actinomyces gibi faydalı bakteriler de bulunur.