Mısır ununun bazı zararları: Kan şekerini yükseltme: Glisemik indeksi yüksek olduğu için aşırı tüketildiğinde kan şekerini hızla yükseltebilir, bu da diyabet hastaları için risklidir. Gaz ve şişkinlik: Lif oranı yüksek olduğu için fazla tüketildiğinde sindirim sistemini zorlayarak karın ağrısı, şişkinlik ve gaz gibi rahatsızlıklara neden olabilir. Alerjik reaksiyonlar: Nadir de olsa mısır alerjisi görülebilir ve bu durumda mısır unu kullanımı zararlı olabilir. Mineral emilimini engelleme: Mısır, fitik asit gibi anti-besin maddeleri içerir ve bu maddeler demir, çinko ve magnezyum gibi minerallerin emilimini zorlaştırabilir. Yüksek kalori içeriği: Aşırı tüketildiğinde kilo alımına neden olabilir. Dengeli bir diyet ve porsiyon kontrolüne dikkat edilerek mısır unu tüketimi önerilir.