Kortizonun "son çare" olarak adlandırılmasının nedeni, yan etkilerinin tedavi ettiği hastalıkların hastaya vereceği kalıcı etkiler düşünüldüğünde tolere edilebilir olmasıdır. Kortizonun bazı yan etkileri şunlardır: çocuklarda gelişim bozukluğu; alerjik reaksiyonlar; enfeksiyona yatkınlık; terleme; yüksek tansiyon; kan şekerinde yükselme; kas zayıflığı; sindirim sistemi problemleri; kilo alma; baş ağrısı. Kortizon, tıbbi bir reçete ile kullanılması gereken bir ilaçtır.