Behçet hastalığı, tehlikeli bir hastalık olarak kabul edilir çünkü organ tutulumları az görülse de, özellikle göz, beyin, büyük damarlar, akciğer, mide-bağırsak ve kalp tutulumlarında ihmal edilirse ölüm görülebilir. Hastalığın yol açabileceği bazı ciddi komplikasyonlar: Körlük: Tedavi edilmemiş üveit, zamanla görmede azalmaya veya körlüğe neden olabilir. Felç: Sinir sistemi tutulumu, baş ağrısı, denge bozuklukları ve felce yol açabilir. İç organ hasarı: Damar tutulumu, karaciğer, kalp ve diğer iç organlarda hasara neden olabilir. Genellikle atak ve iyileşme dönemleri şeklinde yıllarca devam eden Behçet hastalığı, düzenli tedavi gerektirmektedir.