Gram-pozitif ve Gram-negatif bakteriler arasındaki temel farklar şunlardır: Hücre Duvarı Yapısı: Gram-pozitif bakteriler: Kalın, çok katmanlı peptidoglikan hücre duvarına sahiptir. Gram-negatif bakteriler: İnce, tek katmanlı peptidoglikan hücre duvarına sahiptir ve dış zarlarında lipopolisakkarit (LPS) bulunur. Gram Boyama Sonucu: Gram-pozitif bakteriler: Kristal viyole boyayı tutar ve mor renkte görünür. Gram-negatif bakteriler: Kristal viyole boyayı tutmaz, safranin karşı boyası ile pembe-kırmızı renkte boyanır. Antibiyotik Direnci: Gram-pozitif bakteriler: Genellikle antibiyotiklere daha duyarlıdır. Gram-negatif bakteriler: Dış zarları nedeniyle antibiyotiklere daha dirençlidir. Toksin Üretimi: Gram-pozitif bakteriler: Ekzotoksin üretir. Gram-negatif bakteriler: Endotoksin veya ekzotoksin üretebilir.