Anatomide organlar, sistemlere göre adlandırılır. İnsan vücudunda 11 farklı organ sistemi bulunmaktadır: 1. Solunum Sistemi: Burun, ağız, paranazal sinüsler, farinks, larinks, trakea, bronşlar, akciğerler ve torasik diyafram. 2. Sindirim Sistemi: Dişler, dil, tükürük bezleri, yemek borusu, mide, karaciğer, safra kesesi, pankreas, ince bağırsak, kalın bağırsak, rektum ve anüs. 3. Dolaşım Sistemi: Kan, kalp, atardamarlar, toplardamarlar, kılcal damarlar. 4. Üriner Sistem: Böbrekler, üreterler, mesane ve üretra. 5. Örtü Sistemi: Cilt, kıl, ekzokrin bezler, yağ ve tırnaklar. 6. İskelet Sistemi: Kemikler, kıkırdak, bağlar ve tendonlar. 7. Kas Sistemi: İskelet kasları, düz kaslar ve kalp kası. 8. Endokrin Sistem: Hipotalamus, hipofiz, epifiz, tiroid, paratiroid ve adrenal bezler, yumurtalıklar, testisler. 9. Lenfatik Sistem: Lenf, lenf düğümleri, lenf damarları, bademcikler, dalak, timüs. 10. Sinir Sistemi: Beyin, omurilik, sinirler, duyu organları ve duyu sistemleri. 11. Üreme Sistemi: Yumurtalıklar, fallop tüpleri, uterus, vajina, vulva, meme bezleri, penis, testisler, vas deferens, seminal veziküller ve prostat. Organlar ayrıca bölgesel veya makroskopik anatomi gibi farklı anatomi dallarında da adlandırılabilir.