Trizomi 21 ve mozaik Down sendromu arasındaki temel fark, kromozomların düzenlenmesinde yatmaktadır: 1. Trizomi 21: Bu durumda, bireyde normalde iki tane olması gereken 21. kromozomdan üç tane bulunur. 2. Mozaik Down sendromu: Bu durumda, bireyin bazı hücreleri normal 46 kromozoma sahipken, diğer hücreler 47 kromozom içerir ve bu ek kromozom 21. kromozomdur. Sonuç olarak, trizomi 21'de tüm hücrelerde fazladan bir kromozom varken, mozaik Down sendromunda bu durum sadece bazı hücrelerde görülür.