Yenisey Türklerinin kökeni, MÖ 3. yüzyıldan MS 13. yüzyıla kadar Sayan-Altay bölgesinde, Baykal Gölü'nün batısında, Yenisey Nehri'nin aşağısında Minusinsk'in güney kısımlarında yaşamış olan Yenisey Kırgızlarına dayanır. Yenisey Kırgızları, tarihteki ilk Türk boylarından biri olarak kabul edilir ve Hakaslar, Fuyü Gırgıs dilini konuşan Fuyü Kırgızları, Kırgızlar, Altaylar ve Sayan dillerini konuşan Tuvalar/Tofalar/Duhalar/Soyotlar gibi Türk halklarının atalarından biridir.