Pençik sistemi, Yıldırım Bayezid'in padişahlığının son dönemlerine kadar uygulanmaya devam etmiş, ancak Ankara Savaşı'ndan sonra kaldırılmıştır. Bunun nedenleri arasında, fetihlerin durması, iç karışıklıkların ortaya çıkması ve Osmanlı Devleti'nin parçalanma sürecine girmesi yer almaktadır.