Pençik sistemi, Yıldırım Bayezid'in padişahlığının son dönemlerine kadar uygulanmaya devam etmiş, ancak Ankara Savaşı'ndan sonra kaldırılmıştır .
Bunun nedenleri arasında, fetihlerin durması, iç karışıklıkların ortaya çıkması ve Osmanlı Devleti'nin parçalanma sürecine girmesi yer almaktadır . Ayrıca, devşirme sisteminin daha etkili ve güçlü bir asker toplama yöntemi olarak görülmesi de pençik sisteminin kaldırılmasında rol oynamıştır .