Yeniköy Antlaşması'nın önemi şu noktalarda yatmaktadır: 1. Ermeni Islahatı: Antlaşma, Ermenilerin ıslahat taleplerini karşılayarak, Osmanlı Devleti'nin iç işlerine Büyük Devletlerin karışmasına sebep oldu. 2. Rusya'nın Etkinliği: Antlaşma sonrası Rusya'nın Osmanlı Ermenileri üzerindeki etkinliği arttı. 3. Birinci Dünya Savaşı: Antlaşmanın ardından Ermeniler, Rusya ve diğer İtilaf Devletleri'nin yardımıyla tam bağımsızlıklarını elde edebileceklerini düşündüler ve Rus ordusunda savaşmak üzere gönüllü birlikleri teşkilatlandırdılar. 4. Osmanlı'nın Zayıflaması: Antlaşma, Osmanlı Devleti'nin askeri ve yönetimsel zaaflarını ortaya çıkardı ve devletin daha da zayıflamasına yol açtı.