Pegasus uçağının pistten çıkmasının birkaç nedeni olduğu değerlendirilmektedir: 1. Yan rüzgar ve yağışlı hava: Sivil Havacılık Genel Müdürlüğü, uçağın yan rüzgar ve yağışlı pist koşulları nedeniyle pistten çıktığını belirtmiştir. 2. Yakıt tasarrufu baskısı: Pilotların, fazladan yakıt kullanımını önlemek için pisti pas geçmeme baskısı altında oldukları düşünülmektedir. 3. Rüzgar makası: Olay yerinde yapılan ilk değerlendirmede, kazanın yatay ve düşey düzlemlerde görülen rüzgar makası nedeniyle yaşanmış olabileceği belirtilmiştir. 4. Yorgun pist: Sabiha Gökçen Havalimanı'ndaki tek pistin uzun süredir tam bakım yapılmadan kullanılması, kazanın bir diğer nedeni olarak gösterilmiştir.