Müsilajı temizlemek için aşağıdaki yöntemler uygulanabilir: 1. Atıkların Arıtılması: Denizlere dökülen evsel ve endüstriyel atıkların tamamen arıtılarak denize verilmesi, müsilajın oluşumunu azaltır. 2. Azot ve Fosfor Miktarının Azaltılması: Deniz suyundaki azot ve fosfor oranlarının düşürülmesi, müsilajın yayılmasını engeller. 3. Kıyı Bölgelerindeki Atıkların Denetimi: Kıyı bölgelerindeki yerleşim yerlerinin atıklarının direkt olarak denize verilmesi yerine, atık arıtma tesislerine taşınması gerekmektedir. 4. Deniz Sirkülasyonunun İzlenmesi: Denizlerdeki sirkülasyonun izlenmesi ve deniz kirliliğinin erken tespiti için gözlem yapılması önemlidir. Bu yöntemler, müsilajın tekrar oluşmasını ve yayılmasını önlemeye yardımcı olur.