Ekstraksiyonda kullanılan çözücüler, ekstraksiyonun türüne ve amacına göre değişiklik gösterebilir. İşte bazı yaygın çözücüler: Sıvı-sıvı ekstraksiyonunda dietil eter, kloroform, benzen, petrol eteri, karbon tetraklorür gibi organik çözücüler kullanılır. Katı-sıvı ekstraksiyonunda ise hekzan, aseton, eter gibi organik çözücüler tercih edilir. Süperkritik sıvı ekstraksiyonunda ise daha çok karbondioksit (CO2) kullanılır. Ekstraksiyon çözücüsü seçerken dikkat edilen bazı özellikler şunlardır: çözücünün, ekstrakte edilecek maddeyi çözme gücü; çözücünün ortamdan ve çözdüğü maddeden kolayca ayrılabilme özelliği; çözücünün ucuz olması.