"Transformers: Ay'ın Karanlık Yüzü" filmi, Otobotlar ve Decepticonlar arasındaki savaşı konu alır. Filmin hikayesi: 1961 yılında, insanlığın uzaya adım atmasından 8 yıl önce, bir Cybertron uzay gemisi büyük savaştan kaçarak Ay'ın karanlık yüzüne iner. Sentinel Prime'ın kullandığı bu gemi, Cybertronlar için hayati önem taşıyan bir teknolojiyi taşımaktadır. Optimus Prime, bu gizemli gemiyi keşfeder ve Decepticonlar'dan önce teknolojiye ulaşmak için bir yarış başlar. Günümüzde, bir görev sırasında Sentinel Prime'ın uzay aracı aya düşer ve insanoğlu, Sentinel'in gemisini keşfeder. Autobot ekibi, ayın karanlık yüzüne inerek Sentinel Prime ve diğer kolonileri dünyaya getirir ve Optimus Matrix ile Sentinel'i yeniden hayata döndürür. Ancak, Decepticonlar Sentinel'i ele geçirir ve onunla anlaşma yaparak insanoğluna saldırır.