Çek bozdurma ücreti, faktoring şirketleri tarafından çek tutarından düşülerek hesaplanır. Hesaplama şu şekilde yapılır: 1. Faktoring Komisyonu: Çek ana tutarı ile komisyon oranı çarpılarak belirlenir. 2. Faktoring Ücreti: Çekin vadesi, tutarı ve faiz oranları kullanılarak hesaplanır. 3. Toplam Kesinti: Faktoring komisyonu ve ücreti toplandıktan sonra, bu tutar çek tutarından çıkarılır. Komisyon oranları genellikle çek tutarının %10 ila %40'ı arasında değişir ve bu oran, çekin tahsil süresi, riski ve işlem yapılan kurumun politikalarına göre farklılık gösterebilir.