Mahzen ve kiler arasındaki temel fark, mahzenin genellikle yer altı deposu olarak kullanılması ve kısmen veya tamamen yer seviyesinin altına yerleştirilmesidir. Kiler ise, yapılarda bulunan yer altındaki depo veya kiler anlamına gelir, ancak mutlaka yer altında olmak zorunda değildir. Özetle, mahzen daha spesifik olarak yer altı deposu anlamına gelirken, kiler daha genel bir terim olup, yapılarda bulunan yer altındaki depoları ifade eder.