Persistan enfeksiyon, bir enfeksiyon ajanının konakçı vücutta uzun süre kalması ve ortadan kaldırılamaması durumudur. Bu tür enfeksiyonlar, kronik, tekrarlayan, latent ve transforme edici enfeksiyonlar şeklinde olabilir. Nedenleri arasında bağışıklık sisteminin zayıf olması, patojenin virülansı ve altta yatan tıbbi durumlar yer alır.