İbnü'l-Arabî'nin en gizemli kitabı olarak genellikle "Şeceretü’n-Nu’maniyye" ve "Fusûsu’l-Hikem" eserleri gösterilmektedir. Şeceretü’n-Nu’maniyye: Bu kitap hakkında bilgi, Pelin Çift'in "Gündem Ötesi" programındaki bir bölümde ele alınmıştır. Fusûsu’l-Hikem: Anlaşılması oldukça zor bir kitap olarak kabul edilir ve peygamberlerle ilgili görüşleri, özellikle Allah kavramı üzerindeki cesur yaklaşımlarıyla dikkat çeker.